考慮一個(gè)小的含101殘基的蛋白質(zhì)。該蛋白質(zhì)將有200個(gè)可旋轉(zhuǎn)的鍵。并假設(shè)對(duì)每個(gè)鍵φ和ψ有兩個(gè)定向。問(wèn):
(a)這個(gè)蛋白質(zhì)可能有多種隨機(jī)構(gòu)象(W)?
(b)根據(jù)(a)的答案計(jì)算在當(dāng)使1mol該蛋白質(zhì)折疊成只有一種構(gòu)想的結(jié)構(gòu)時(shí)構(gòu)想熵的變化(ΔS折疊);
(c)如果蛋白質(zhì)完全折疊成由H鍵作為穩(wěn)定焓的唯一來(lái)源的α螺旋,并且每mol H鍵對(duì)焓的貢獻(xiàn)為-5kj/mol,試計(jì)算ΔH折疊;
(d)根據(jù)逆的(b)和(c)的答案,計(jì)算25℃時(shí)蛋白質(zhì)的ΔG折疊。該蛋白質(zhì)的折疊形式在25℃時(shí)是否穩(wěn)定?
α螺旋的穩(wěn)定性不僅取決于肽鏈間的氫鍵形成,而且還取決于肽鏈的氨基酸側(cè)鏈的性質(zhì)。試預(yù)測(cè)在室溫下的溶液中下列多聚氨基酸那些種將形成α螺旋,那些種形成其他的有規(guī)則的結(jié)構(gòu),哪些種不能形成有規(guī)則的結(jié)構(gòu)?并說(shuō)明理由。
(1)多聚亮氨酸,pH=7.0;
(2)多聚異亮氨酸,pH=7.0;
(3)多聚精氨酸,pH=7.0;
(4)多聚精氨酸,pH=13;
(5)多聚谷氨酸,pH=1.5;
(6)多聚蘇氨酸,pH=7.0;
(7)多聚脯氨酸,pH=7.0;