在瓊脂糖凝膠電泳中，DNA分子帶負(fù)電荷，來源于其磷酸骨架。因電荷密度均一，DNA分子所帶電荷與分子量成正比。

電泳就是在電場作用下各種膠體顆粒的遷移。具有不同電荷密度的生物大分子將以不同的速度遷移，從而得以分離。

泡沫分離過程中，高速攪拌表面活性劑溶液制備的泡沫尺寸更小、穩(wěn)定性更強，分離效果更好。

等電聚焦電泳按照形成pH梯度方式可分為載體兩性電解質(zhì)等電聚焦電泳和固相pH梯度等電聚焦電泳。

目前的電泳多數(shù)在自由溶液中進行。