雙向電泳就是第一向采用等電聚焦分離，第二向為SDS-PAGE分離。

等電聚焦電泳按照形成pH梯度方式可分為載體兩性電解質等電聚焦電泳和固相pH梯度等電聚焦電泳。

在雙向電泳系統中無需濃縮膠，因為第一向等電聚焦已經使得蛋白得到濃縮。

泡沫分離過程中為了獲得較高的收率和分離純化效果，可采用多柱串聯操作模式。

泡沫分離過程中，高速攪拌表面活性劑溶液制備的泡沫尺寸更小、穩(wěn)定性更強，分離效果更好。