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【簡答題】打分矩陣有哪些?
答案:
(1)核酸打分矩陣:
等價矩陣、BLAST矩陣、轉(zhuǎn)換-顛換矩陣
(2)蛋白質(zhì)打分矩陣:
等...
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問答題
【簡答題】如何選擇合適的評分矩陣?
答案:
一般來說,在局部相似性搜索上,BLOSUM矩陣較PAM要好
當(dāng)比較距離相近的蛋白時,應(yīng)選擇低的PAM或高的BL...
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問答題
【簡答題】簡述PAM矩陣與BLUSUM矩陣的關(guān)系
答案:
(1)兩者都在打分系統(tǒng)中使用對數(shù)比值;
(2)PAM矩陣是基于近相關(guān)蛋白家族數(shù)據(jù)的,并且假設(shè)高度相關(guān)蛋白的取...
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