【案例分析題】女職工A某被一家公司錄用。雙方簽定勞動合同期限為4年。簽定合同的第3年A某開始休產(chǎn)假。原公司合同規(guī)定：“女職工符合計劃生育規(guī)定生育的，產(chǎn)假為56天”。A某沒有按照公司的規(guī)定休產(chǎn)假，而是按照國家規(guī)定休息了90天。當A某上班時，公司根據(jù)內(nèi)部規(guī)定，認定超出56天的假期為曠工，并給予除名處理。A某認為曠工一事不是事實，向有關部門提出申述。你認為勞動保障部門應如何處理？依據(jù)是什么？